BLS Cargo is opgericht in 2001 en is nu de grootste particuliere onderneming in Alpine transitovervoer door Zwitserland. Het bedrijf richt zich op de business met lean structuren met treinen. Een focus ligt op internationale treinen in transitoverkeer door de Alpen via de Lötschberg, Gotthard en Simplon as.

BLS Cargo geopend in 2002, het maatschappelijk kapitaal om sterke Europese partnerschappen op te bouwen. Sindsdien is een 45%-deelneming en IMT AG (Italiaanse Ambrogio groep) met 3% in BLS Cargo AG naast de BLS AG (52% van de aandelen), DB Zwitserland Holding AG.

Het aandeel van BLS Cargo markt in de Zwitserse doorvoer per spoor is ongeveer 43%. Zo is BLS Cargo een steunpilaar in het Zwitserse spoorweglandschap en draagt ​​aanzienlijk bij tot de verwezenlijking van de modal shift doelstellingen van de Federatie.

In juni 2019 nam de Zwitserse BLS Cargo 100% van de aandelen van vervoerder Crossrail Benelux over. Hiervoor waren 100% van de aandelen van Crossrail Benelux in handen van Rhenus Rail. Onder BLS Cargo, en eerder ook onder Rhenus Rail, bleef Crossrail Benelux onder haar eigen naam rijden. Per 1 september 2025 veranderde de naam Crossrail Benelux in BLS Cargo Nord. Vanaf eind juli 2025 werd begonnen met het verwijderen van alle Crossrail-logo's van de locomotieven. Bij een deel van de locomotieven werden BLS Cargo-logo's op de locomotieven teruggeplaatst. Op 26 juli kwam de Class 66 met het nummer DE6308 als eerste naar buiten met BLS-logo's.